Procedures

Procedure	Location	Procedure Type	Description
accumulate_charge_ledger	bem_charge_ledger	Subroutine	連続する batch ledger を、初期 stock と最終 stock を保って累積する。
acquire_file_lock	bem_filesystem	Subroutine
active_tree_child_count	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木の指定ノードにある子ノード数を返す。
active_tree_child_idx	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木の子ノード番号を返す。
active_tree_child_octant	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木の子ノードが属する八分木番号を返す。
active_tree_level_bounds	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Subroutine	指定深さのレベル範囲を返す。
active_tree_level_node	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	レベル配列からノード番号を返す。
active_tree_max_depth	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木の最大深さを返す。
active_tree_nnode	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	現在有効な木のノード数を返す。
active_tree_node_center	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木のノード中心座標を返す。
active_tree_node_half_size	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木のノード半サイズを返す。
active_tree_node_radius	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	有効な木のノード外接半径を返す。
add_periodic2_exact_ewald_correction_single_source	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Subroutine	1 粒子分の periodic2 Ewald 補正を加算する。
add_periodic2_exact_ewald_kneq0_correction_single_source	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Subroutine
add_periodic2_exact_ewald_potential_correction_single_source	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Subroutine	1 粒子分の periodic2 Ewald の電位補正を加算する。
add_periodic2_kneq0_potential_correction_single_source	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Subroutine
add_point_charge_images_field	bem_coulomb_fmm_periodic	Subroutine	画像電荷を足し合わせて点電荷の電場を加算する。
advance_particle_step	bem_particle_stepper	Subroutine	一つの粒子stepについてmesh/boxの最早eventを順序付ける。
advance_particle_step_upper_panel_fourier	bem_particle_stepper	Subroutine	上部真空域のfactorized P0-panel Fourier場だけで、失敗した1 stepを最初から再試行する。
allocate_particles	bem_particles	Subroutine	粒子数に一致するSoA領域を確保する。位置・速度・電荷・質量は呼出し元で埋める。重みは1、粒子種IDは0、放出元は-1、aliveはtrueで初期化する。
append_i32_buffer	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Subroutine	整数バッファへ値を追加し、必要なら容量を拡張する。
append_mesh_ids	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	既存の要素メッシュID配列へ追加分を連結する。
append_particles	bem_particles	Subroutine	既存 SoA の末尾へ粒子群を追加し、既存の alive 状態を保持する。
append_real_values	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	既存の実数要素配列へ追加分を連結する。
append_triangles	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	既存三角形配列へ追加分を連結し、再確保後の配列へ差し替える。
apply_box_boundary	bem_boundary	Subroutine	1ステップの更新候補位置にボックス境界条件を適用し、生存/流出状態と位置速度を更新する。
apply_domain_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_escape_reflect_periodic_event	bem_boundary	Subroutine	最初のbox eventへescape/reflect/redistributed-reflect/periodicを軸順序に依存せず適用する。
apply_field_boundary_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_mesh_group_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_mesh_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_obj_transform	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	OBJ メッシュの全頂点にスケール→回転→平行移動を適用し再初期化する。変換順序: v_new = R(rotation) * (v_old * scale) + offset 回転は度単位で x→y→z の順に外因性 (extrinsic) 回転を適用する。
apply_output_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_panel_surface_config	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine
apply_particle_boundary_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_particles_species_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_particles_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_periodic2_minimum_image	bem_coulomb_fmm_periodic	Subroutine	periodic2 の minimum image を差分ベクトルへ適用する。
apply_periodic2_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_physics_authoring	bem_app_config_parser	Interface
apply_reservoir_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_sim_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_species_boundary_inflow_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_species_boundary_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_surface_current_model_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_surface_model_charge_relaxation	bem_surface_models	Subroutine	表面モデルに応じて、電荷堆積後の要素電荷を緩和する。 conductor は mesh_id ごとの浮遊導体として、総電荷を保存しながら等電位化する。
apply_template_toml_table	bem_app_config_parser	Interface
apply_toml_document	bem_app_config_parser	Subroutine	`toml-f` のルートテーブルから既知セクションを読み込む。
apply_uniform_epsilon_r	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	全要素に同じ相対誘電率を付与する。
apply_uniform_surface_model	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	全要素に同じ表面モデルIDを付与する。
atomic_rename	bem_filesystem	Subroutine
bbox_inside_box	bem_collision	Function
beach_kernel_build	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_create	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_destroy	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_eval_e	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_eval_e_direct	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_eval_phi	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_eval_phi_direct	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_force_on_charges	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_get_abi_version	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_get_build_info	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_get_periodic_cache_info	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_set_periodic_cache	bem_field_kernel_c	Function
beach_kernel_update_charges	bem_field_kernel_c	Function
beach_zero_mode_build	bem_periodic_zero_mode_c	Function
beach_zero_mode_create	bem_periodic_zero_mode_c	Function
beach_zero_mode_destroy	bem_periodic_zero_mode_c	Function
beach_zero_mode_eval	bem_periodic_zero_mode_c	Function
beach_zero_mode_update	bem_periodic_zero_mode_c	Function
begin_checkpoint_publish	bem_checkpoint_contract	Subroutine	checkpoint transactionのcompletion evidenceをrestart-bearing fileの置換前に無効化する。
boris_push	bem_pusher	Subroutine	Boris速度更新を使い、1タイムステップ後の位置・速度を計算する。
boris_update_velocity	bem_pusher	Subroutine	電場半ステップ加速と磁場回転を組み合わせ、1タイムステップ後の速度を計算する。
boundary_face_name	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	face bit順の面名を返す。
boundary_inflow_face_enabled	bem_app_config_particle_runtime	Function	face bit順の面に reservoir 流入が有効かを返す。
build_axis_powers	bem_coulomb_fmm_basis	Subroutine	3 軸の冪を order まで順に計算する。
build_collision_grid	bem_mesh	Subroutine	三角形AABBを一様グリッドへ登録し、衝突判定の候補探索を高速化する。要素数が少ない場合は線形探索にフォールバックする。
build_mesh_from_config	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	`mesh_mode` と OBJ ファイル有無に応じてメッシュ生成方法を選ぶ。
build_mesh_from_indexed	bem_importers	Subroutine	頂点配列と三角形インデックス配列から面頂点配列(v0,v1,v2)を展開して初期化する。
build_one_template	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	テンプレート種別に応じて形状生成ルーチンへディスパッチする。
build_panel_duffy_quadrature	bem_triangle_quadrature	Subroutine
build_panel_plan	bem_coulomb_fmm_core	Interface
build_panel_quadrature	bem_triangle_quadrature	Subroutine
build_particle_source_plan	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	設定とMPI配置だけに依存する粒子 source の導出値を構築する。乱数、残差、mesh/snapshot依存の障壁は扱わず、run中に不変な値だけを保持する。
build_particle_step_candidate	bem_particle_stepper	Subroutine	予測中点の電場と一様磁場を使い、次時刻の位置・速度候補を返す。
build_periodic_shift_values	bem_coulomb_fmm_periodic	Subroutine	periodic2 の画像シフト値を作成する。
build_periodic_zero_mode_height_plan	bem_periodic_zero_mode_plan	Subroutine
build_periodic_zero_mode_plan	bem_periodic_zero_mode_plan	Subroutine
build_plan	bem_coulomb_fmm_core	Interface
build_template_mesh	bem_app_config_mesh_runtime	Subroutine	有効なテンプレートを連結し、1つのメッシュへまとめる。
build_zhao_params	bem_sheath_model_core	Subroutine
cell_id	bem_collision	Function	3次元セル添字 `(ix,iy,iz)` をCSR一次元インデックスへ変換する。
cell_id	bem_mesh	Function	3次元セル添字 `(ix,iy,iz)` をCSR一次元インデックスへ変換する。
checked_accumulate_charge	bem_charge_ledger	Subroutine	有限なcharge incrementをoverflowさせずscalar accumulatorへ加える。
checkpoint_schema_is_loadable	bem_checkpoint_contract	Function	現行実装が再開候補として扱えるcheckpoint schemaかを返す。 schema keyを持たないlegacy summaryは0として表す。schema v1は正式な fingerprint contractより前の中間形式であり、現行loaderは対応しない。
compute_face_area_from_bounds	bem_injection_geometry	Function	注入面上の矩形開口から有効面積[m^2]を返す。
compute_face_average_potential	bem_app_config_potential_runtime	Subroutine	reservoir_face 開口面の平均電位を `N x N` 格子平均で評価する。
compute_inflow_flux_from_drifting_maxwellian	bem_injection_flux	Function	drifting Maxwellian の片側流入束 [#/m^2/s] を返す。
compute_laplace_derivatives	bem_coulomb_fmm_basis	Subroutine	ラプラス核の多重微分係数を計算する。
compute_macro_particles_for_batch	bem_injection_flux	Subroutine	物理流量・重み・残差から今バッチのマクロ粒子数を決める。
compute_macro_particles_for_species	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	reservoir_face 用に、物理流量と残差から今バッチのマクロ粒子数を決める。
compute_macro_particles_from_flux	bem_injection_flux	Subroutine	指定済み粒子 flux・重み・残差から今バッチのマクロ粒子数を決める。
compute_periodic_shift_bounds	bem_collision	Subroutine	線分 AABB と canonical mesh AABB の重なりから必要な image shift 範囲を決める。
compute_z_high_box_potential_statistics	bem_app_config_potential_runtime	Subroutine	box の z-high 全断面における電位統計をセル中心 `N x N` 格子で評価する。 Read more…
config_uses_surface_model	bem_app_config_parser	Function	現在のメッシュ入力設定が指定された表面モデルを使うかを返す。
configure_plane_source_box	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	plane_sourceの内部面をlegacy face samplerの仮想box境界へ写像する。
coord_to_cell	bem_collision	Function	座標をグリッドセル添字へ変換し、範囲外は端セルへ丸める。
coord_to_cell	bem_mesh	Function	座標をグリッドセル添字へ変換し、範囲外は端セルへ丸める。
core_build_panel_plan_impl	bem_coulomb_fmm_plan_ops	Subroutine
core_build_plan_impl	bem_coulomb_fmm_plan_ops	Subroutine	FMM 計画と木構造、転送演算子を構築する。
core_destroy_plan_impl	bem_coulomb_fmm_plan_ops	Subroutine	FMM 計画に確保した資源を解放する。
core_destroy_state_impl	bem_coulomb_fmm_state_ops	Subroutine	FMM state に確保した資源を解放する。
core_eval_direct_points_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	非周期計画の全ソース直接和で複数点の電場を計算する。
core_eval_direct_potential_points_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	非周期計画の全ソース直接和で複数点の電位を計算する。
core_eval_point_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	1 点で電場を計算する。
core_eval_points_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	複数の評価点で電場を計算する。
core_eval_potential_point_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	1 点で電位を計算する。
core_eval_potential_points_impl	bem_coulomb_fmm_eval_ops	Subroutine	複数の評価点で電位を計算する。
core_update_state_impl	bem_coulomb_fmm_state_ops	Subroutine	ソース電荷から FMM state を更新する。
corner_between	bem_templates	Subroutine	反時計回りに隣接する辺ペアに対し、対応する長方形コーナー座標を返す。
count_face_tokens	bem_importers	Function	面行に含まれる頂点トークン数を数え、扇形分割時の三角形数算出に使う。
create_directories	bem_filesystem	Subroutine	Recursively create a directory path without invoking a shell.
cross	bem_collision	Function
cross	bem_pusher	Function	3次元ベクトルの外積を返す基本演算。
cross	bem_mesh	Function	3次元ベクトルの外積を返す基本演算。
default_app_config	bem_app_config_types	Subroutine	`app_config` を既定値で初期化し、TOML 上書き前の状態を作る。
derive_field_panel_config	bem_physics_config_types	Subroutine	`[sim]` だけから field/panel の派生契約を構築する。
destroy_plan	bem_coulomb_fmm_core	Interface
destroy_state	bem_coulomb_fmm_core	Interface
distance_to_source_bbox	bem_coulomb_fmm_periodic	Function	点と source BBox の距離を返す。
distance_to_source_bbox_periodic	bem_coulomb_fmm_periodic	Function	periodic2 の minimum image を考慮した source BBox 距離を返す。
edge_next_ccw	bem_templates	Function	境界辺の次（反時計回り）を返す。
edge_order_index	bem_templates	Function	境界辺の反時計回り順序インデックスを返す。
ensure_authoring_group_capacity	bem_app_config_authoring	Subroutine	mesh group authoring 配列容量を確保する。
ensure_authoring_particle_capacity	bem_app_config_authoring	Subroutine	species authoring 配列容量を確保する。
ensure_authoring_template_capacity	bem_app_config_authoring	Subroutine	template authoring 配列容量を確保する。
ensure_output_dir	bem_output_writer	Subroutine	出力ディレクトリを作成する。
ensure_particle_species_capacity	bem_app_config_parser	Interface
ensure_template_capacity	bem_app_config_parser	Interface
eval_direct_points	bem_coulomb_fmm_core	Interface
eval_direct_potential_points	bem_coulomb_fmm_core	Interface
eval_periodic_nonzero_panel_reference	bem_coulomb_fmm_periodic_nonzero_reference	Subroutine
eval_periodic_zero_mode	bem_periodic_zero_mode_eval	Subroutine
eval_point	bem_coulomb_fmm_core	Interface
eval_points	bem_coulomb_fmm_core	Interface
eval_potential_point	bem_coulomb_fmm_core	Interface
eval_potential_points	bem_coulomb_fmm_core	Interface
evaluate_monotonic_stationary_phi	bem_sheath_model_core	Subroutine
evaluate_surface_closure	bem_surface_current_model	Subroutine	モデル固有の診断値をシミュレータへ漏らさず、境界契約だけを返す。
evaluate_surface_current_model	bem_surface_current_model	Subroutine	設定されたmodelをdispatchし、固定電流closure用のtarget配列を返す。
evaluate_zhao_density_hat	bem_sheath_model_core	Subroutine
evaluate_zhao_rho_hat	bem_sheath_model_core	Subroutine
external_kinetic_face_velocity_correction	bem_app_config_particle_runtime	Interface
fill_panel_quadrature	bem_triangle_quadrature	Subroutine	Fill an existing seven-point cubature buffer without allocating a plan.
find_first_boundary_event	bem_boundary	Subroutine	閉じたbox内の始点から候補終点へ向かう線分について、最初のbox面交差を返す。
find_first_hit	bem_collision	Subroutine	線分 `[p0,p1]` に対して最初に衝突する三角形要素を探索し、命中情報を返す。
find_first_hit_base	bem_collision	Subroutine	通常メッシュに対する最初の命中要素探索を行う。
find_first_hit_base_grid	bem_collision	Subroutine	一様グリッド + 3D-DDA で候補セルのみ探索し、最初の命中要素を返す。
find_first_hit_base_linear	bem_collision	Subroutine	旧実装と同じ線形探索で最初の命中要素を探索する。
find_first_hit_periodic2	bem_collision	Subroutine	periodic2 用に image shift を列挙し、base collision の結果を統合する。
finite_charge_sum	bem_charge_ledger	Function	scale後のNeumaier和により、中間overflowを避けてsigned charge総和を返す。
gauss_legendre_unit	bem_triangle_quadrature	Subroutine
generate_matching_plane_zhao_atlas	bem_matching_plane_zhao_atlas	Subroutine
generate_matching_plane_zhao_response_table	bem_matching_plane_response_generator	Subroutine	5列query gridを評価し、既存table backend互換の11列CSVを書く。
get_matching_plane_response_snapshot	bem_matching_plane_response	Subroutine	path ごとに最初の検証済み内容を固定し、同一 process 内で共有する。
get_toml_boundary_inflow_mode	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_int	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_logical	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_particle_boundary_mode	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_real	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_real_array	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_real_scalar_or_array3	bem_config_toml	Subroutine
get_toml_string	bem_config_toml	Subroutine
get_velocity_grid_snapshot	bem_injection_velocity_grid	Subroutine	最初の読込み結果をpathごとに固定し、同一runのsamplingとfingerprintで共有する。
handle_early_cli	main	Subroutine	MPI 初期化や計算状態の構築前に完結する CLI option を処理する。
has_boundary_inflow	bem_app_config_particle_runtime	Function	speciesに外部 reservoir 流入を指定したbox面があるかを返す。
has_suffix	bem_app_config_parser	Function	文字列が指定した接尾辞で終わるかを判定する。
has_valid_target_box	bem_coulomb_fmm_periodic	Function	periodic2 の target box が有効かを判定する。
init_app_config_authoring	bem_app_config_authoring	Subroutine	authoring overlay の配列を初期化する。
init_mesh	bem_mesh	Subroutine	三角形頂点配列から `mesh_type` を初期化し、幾何キャッシュと要素電荷配列を準備する。
init_panel_geometry	bem_panel_geometry	Subroutine
init_particle_batch_from_config	bem_app_config_particle_runtime	Interface
init_particles	bem_particles	Subroutine	位置・速度・電荷・質量(と任意重み)配列から `particles_soa` を検証付きで構築する。
init_random_beam_particles	bem_injection_random	Subroutine	指定粒子数ぶんの位置/速度/電荷/質量/重みを生成し `particles_soa` を初期化する。
initialize_basis_tables	bem_coulomb_fmm_basis	Subroutine	FMM の多重指数テーブルと評価用補助テーブルを初期化する。
initialize_fmm_state	bem_coulomb_fmm_types	Subroutine	FMM state のポインタ成分を未関連状態へ初期化する。
initialize_hit	bem_collision	Subroutine	hit 構造体を未命中状態へ初期化する。
initialize_injection_state	main	Subroutine	種数に合わせて注入状態をゼロ初期化する。
injection_face_index	bem_app_config_particle_runtime	Function	面名をboundary bit順のindexへ変換する。
inspect_checkpoint_directory	bem_checkpoint_contract	Subroutine	Inspect one directory without mutating it and require every file declared by its checkpoint generation.
is_decimal_integer_token	bem_string_utils	Function	符号付き十進整数tokenだけを許可する。
is_decimal_real_token	bem_string_utils	Function	List-directed control syntaxを除外した十進実数tokenだけを許可する。
is_face_line	bem_importers	Function	与えられた行がOBJ面行(`f`)かを判定する。
is_logical_token	bem_string_utils	Function	Checkpoint writerが生成するlogical tokenと標準的な長形式だけを許可する。
is_vertex_line	bem_importers	Function	与えられた行がOBJ頂点行(`v`)かを判定する。
load_app_config	bem_app_config_parser	Subroutine	`.toml` 拡張子の設定ファイルを読み込み、既存値へ上書き適用する。
load_matching_plane_response_mpi	bem_matching_plane_response	Interface
load_obj_mesh	bem_importers	Subroutine	OBJファイルを2パス(件数取得→実データ読込)で読み込み、メッシュを構築する。
load_or_init_run_state	main	Subroutine	設定読込・メッシュ構築・再開判定・乱数初期化をまとめて行う。
load_restart_checkpoint	bem_restart	Subroutine	既存チェックポイントディレクトリから統計・要素電荷・乱数状態を復元する。
load_toml_config	bem_app_config_parser	Subroutine	TOML 文書を `toml-f` で解釈して設定へ反映する。現在は `sim` / `mesh` / `output` / `[[mesh.templates]]` / `[[particles.species]]` を扱う。
lower_ascii	bem_string_utils	Function	ASCII 英字を小文字化した文字列を返す。
lower_boundary_authoring	bem_app_config_authoring	Interface
make_annulus	bem_templates	Subroutine	XY平面上の同心リングを極座標分割し、三角形メッシュを生成する。
make_boundary_inflow_spec	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	box全面を開口とする一時的な legacy reservoir spec を構築する。
make_box	bem_templates	Subroutine	直方体6面を分割数に応じて三角形化し、外向き法線向きでメッシュを生成する。
make_cylinder	bem_templates	Subroutine	円柱側面を分割生成し、必要に応じて上下面キャップを追加したメッシュを生成する。
make_disk	bem_templates	Subroutine	XY平面上の円板を極座標分割し、外周へ向かって三角形化したメッシュを生成する。
make_plane	bem_templates	Subroutine	XY平面を `nx*ny` 分割し、各セルを2三角形へ分割したメッシュを生成する。
make_plate_hole	bem_templates	Subroutine	XY平面の長方形プレートから円形穴を除いたメッシュを生成する。穴境界は `n_theta` 分割の多角形近似で表し、外周は長方形境界に一致させる。
make_sphere	bem_templates	Subroutine	経度・緯度分割に基づき球面三角形メッシュを生成する。
maybe_write_periodic_checkpoint	bem_periodic_checkpoint	Subroutine	設定した stride の accepted batch で、非active slotへ完全な再開状態を書いてからindexを切り替える。
mesh_fingerprint	bem_mesh_identity	Function
mpi_allreduce_max_i32_scalar	bem_mpi	Subroutine	32bit整数スカラの最大値Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_max_real_dp_array	bem_mpi	Subroutine	倍精度配列の最大値Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_min_i32_scalar	bem_mpi	Subroutine	32bit整数スカラの最小値Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_min_real_dp_array	bem_mpi	Subroutine	倍精度配列の最小値Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_sum_i32_array	bem_mpi	Subroutine	32bit整数配列の総和Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_sum_i32_scalar	bem_mpi	Subroutine	32bit整数スカラの総和Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_sum_i64_array	bem_mpi	Subroutine	64bit整数配列の総和Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_sum_real_dp_array	bem_mpi	Subroutine	倍精度配列の総和Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_allreduce_sum_real_dp_scalar	bem_mpi	Subroutine	倍精度スカラの総和Allreduceをin-placeで実行する。
mpi_bcast_i32_array	bem_mpi	Subroutine	root rankの32bit整数配列を全rankへbroadcastする。
mpi_bcast_real_dp_array	bem_mpi	Subroutine	root rankの倍精度配列を全rankへbroadcastする。
mpi_gatherv_real_dp_array	bem_mpi	Subroutine	各rankの可変長倍精度配列をrootへrank順に連結する。 Read more…
mpi_get_rank_size	bem_mpi	Subroutine	`mpi_context` から rank/size を取得する。未指定時は単一rank(0/1)。
mpi_initialize	bem_mpi	Subroutine	MPIを初期化して rank / size を取得する。非MPIビルドでは単一ランクを返す。
mpi_is_root	bem_mpi	Function	root rank (rank=0) かどうかを返す。
mpi_select_lowest_rank_i32_values	bem_mpi	Subroutine	Select values supplied by the lowest MPI rank whose local flag is true.
mpi_shutdown	bem_mpi	Subroutine	`mpi_initialize` が実際に初期化した場合のみ `MPI_Finalize` を呼ぶ。
mpi_split_count	bem_mpi	Function	総数 `total_count` をrankへ均等分割したときの局所個数を返す。
mpi_world_barrier	bem_mpi	Subroutine	全rankの同期ポイント。
mpi_world_size	bem_mpi	Function	MPI world size を返す（size<=0 は 1 へ補正）。
nodes_well_separated	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	target/source ノードが十分離れているかを判定する。
normalize_high_level_config	bem_app_config_authoring	Subroutine	authoring overlay の高水準キーを `cfg` の実行時キーへ反映する。
normalize_legacy_physics_config	bem_physics_config_types	Subroutine	現行 `sim_config` を型付き場設定へ写像する。
normalize_reservoir_positions	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	reservoir/plane sourceの初期位置を、設定されたbox境界条件に従って有効領域へ正規化する。
numerical_jacobian	bem_sheath_model_core	Subroutine
octant_index	bem_coulomb_fmm_tree_utils	Function	座標が親ノード中心のどの八分木に属するかを返す。
open_history_writer	bem_output_writer	Interface
open_matching_plane_history_writer	bem_output_writer	Interface
open_potential_history_writer	bem_output_writer	Interface
open_top_reference_history_writer	bem_output_writer	Interface
panel_on_surface_integrals	bem_panel_self_terms	Subroutine
panel_oracle_potential_field	bem_panel_quadrature	Subroutine
panel_potential_field	bem_panel_kernel	Subroutine
panel_singular_potential_oracle	bem_panel_quadrature	Subroutine
parse_face_line	bem_importers	Subroutine	`f` 行の頂点参照を抽出し、`v/vt/vn` 形式から頂点インデックスのみを取り出す。
parse_obj	bem_importers	Subroutine	OBJの頂点/面行を解析し、負インデックス対応で配列へ格納する。
parse_vertex_line	bem_importers	Subroutine	`v x y z` 形式の頂点行を3次元座標へ変換する。
particle_boundary_action_for_face	bem_config_helpers	Function	6面名に対応する有効粒子境界作用を返す。
particles_per_batch_from_config	bem_app_config_types	Function	有効な粒子種の `npcls_per_step` を合計し、1バッチあたりの粒子数を返す。 1つ以上の粒子種が有効で、かつ合計が正でない場合は停止する。
perf_add_elapsed	bem_performance_profile	Subroutine	経過時間と呼び出し回数を累積する。
perf_configure	bem_performance_profile	Subroutine	明示フラグで計測状態を設定する。
perf_configure_from_env	bem_performance_profile	Subroutine	環境変数 `BEACH_PROFILE` から計測状態を初期化する。
perf_is_enabled	bem_performance_profile	Function	粗粒度プロファイルが有効かを返す。
perf_region_begin	bem_performance_profile	Subroutine	フェーズ開始時刻を取得する。
perf_region_end	bem_performance_profile	Subroutine	フェーズ終了時刻との差分を累積する。
perf_reset	bem_performance_profile	Subroutine	プロファイラ状態を既定値へ戻す。
perf_set_output_context	bem_performance_profile	Subroutine	出力先ディレクトリとファイル書き出し可否を登録する。
perf_wall_time_seconds	bem_performance_profile	Function	OpenMP有効時は `omp_get_wtime`、それ以外は `system_clock` を使う壁時計。
perf_write_outputs	bem_performance_profile	Subroutine	集計済みプロファイルを標準出力および CSV へ書き出す。
periodic_cache_fingerprint	bem_coulomb_fmm_periodic_cache	Function
periodic_operator_checksum	bem_coulomb_fmm_periodic_cache	Function
point_inside_box	bem_collision	Function
point_inside_box_periodic2	bem_collision	Function
point_triangle_distance	bem_panel_geometry	Function
precompute_periodic2_ewald_data	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Subroutine	periodic2 Ewald の事前計算データを作成する。
precompute_periodic_root_operator	bem_coulomb_fmm_periodic_root_ops	Subroutine	periodic2 の root operator を前計算する。
prefer_periodic_candidate	bem_collision	Function	候補 hit が現在の best より優先されるかを deterministic に判定する。
prepare_periodic2_collision_mesh	bem_mesh	Subroutine	periodic2 用に primitive cell メッシュを canonical unwrapped 形へ平行移動し、幾何キャッシュと collision grid を再構築する。
prepare_regularized_qr	bem_regularized_qr	Subroutine
print_run_summary	bem_output_writer	Subroutine	実行結果の主要統計を標準出力へ表示する。
print_usage	zhao_response_main	Subroutine
print_usage	zhao_atlas_main	Subroutine
publish_checkpoint_manifest	bem_checkpoint_contract	Subroutine	A complete manifest is atomically published only after every restart-bearing file is closed.
push_tri	bem_templates	Subroutine	三角形頂点 `a,b,c` を出力配列の次インデックスへ書き込む。
ray_to_rectangle	bem_templates	Subroutine	XY平面上で、中心からのレイと長方形境界の最短交点を返す。
read_matching_plane_query_csv	bem_matching_plane_query_io	Subroutine	指定 header の列数だけ有限の十進実数を読み、入力順の列ベクトルとして返す。
read_mesh_groups_table	bem_app_config_parser	Interface
read_particle_species_array	bem_app_config_parser	Interface
read_periodic_operator_cache	bem_coulomb_fmm_periodic_cache	Subroutine
read_template_array	bem_app_config_parser	Interface
refresh_periodic_zero_mode_state	bem_periodic_zero_mode_plan	Subroutine
release_file_lock	bem_filesystem	Subroutine
require_toml_success	bem_config_toml	Subroutine
reservoir_face_velocity_correction	bem_app_config_particle_runtime	Interface
reset_fmm_plan	bem_coulomb_fmm_types	Subroutine	FMM plan を初期状態へ戻す。
reset_fmm_state	bem_coulomb_fmm_types	Subroutine	FMM state を初期状態へ戻す。
reset_matching_plane_response_snapshot_cache	bem_matching_plane_response	Subroutine	独立 run や unit test の開始時に immutable snapshot cache を解放する。
reset_periodic2_ewald_data	bem_coulomb_fmm_types	Subroutine	periodic2 Ewald 用の補助データを初期状態へ戻す。
reset_velocity_grid_snapshot_cache	bem_injection_velocity_grid	Subroutine	独立runを同一processで開始するtest/support用途にsnapshot cacheを解放する。
residual_norm	bem_sheath_model_core	Function
resolve_batch_duration	bem_app_config_parser	Interface
resolve_box_filter_args	bem_collision	Subroutine	box filter 関連の optional 引数を検証付きで展開する。
resolve_config_path	main	Subroutine	実行時設定ファイルの読み込みパスを決定する。
resolve_external_boundary_contract	bem_external_boundary_contract	Subroutine	局所流入補正と通常 open 面モデルを一意な組へ解決する。
resolve_external_e_field	bem_app_config_parser	Interface
resolve_face_axes	bem_injection_geometry	Subroutine	注入面名から接線2軸を返す。
resolve_face_geometry	bem_injection_geometry	Subroutine	注入面名から法線方向の幾何情報を返す。
resolve_face_sampling_geometry	bem_app_config_potential_runtime	Subroutine	注入面名から法線軸・接線軸・境界値・内向き法線を返す。
resolve_field_solver_mode	bem_field_solver	Interface
resolve_field_solver_tree_params	bem_field_solver	Interface
resolve_inject_face	bem_config_helpers	Subroutine	注入面識別子から法線軸と対応境界座標を返す。
resolve_inward_normal	bem_config_helpers	Subroutine	注入面識別子から内向き法線ベクトルを返す。
resolve_latest_checkpoint_dir	bem_periodic_checkpoint	Subroutine	base directory直下の最終出力と両定期slotを比較し、batch数が新しい完全checkpointを返す。 indexは同batchのslotを選ぶtie-breakにだけ使う。欠落、破損、古いindexは complete manifestを持つload可能なslotの回収を妨げない。
resolve_panel_surface_sides	bem_panel_surface_sides	Subroutine
resolve_parallel_rank_size	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	併存対応のため `mpi_context` と rank/size の両方を受け、最終的なrank/sizeを解決する。
resolve_particle_boundaries	bem_config_helpers	Subroutine	domain topology、global既定、粒子種overrideから有効な粒子境界を解決する。
resolve_particle_boundary_candidate	bem_particle_stepper	Subroutine	構築済みcandidateとその場評価値からbox eventを解決する。
resolve_periodic2_collision_config	bem_collision	Subroutine	periodic2 collision で必要な 2 軸周期設定を解決する。
resolve_periodic2_collision_config	bem_mesh	Subroutine	periodic2 collision で使う 2 軸周期設定を検証付きで解決する。
resolve_periodic2_ewald_alpha	bem_coulomb_fmm_periodic_ewald	Function	periodic2 Ewald の減衰係数 alpha を決定する。
resolve_surface_current_model_path	bem_app_config_parser	Subroutine	response table の相対パスを設定ファイルの配置ディレクトリ基準へ解決する。
restart_macro_residual_path	bem_restart	Interface
restart_rng_state_path	bem_restart	Interface
run_absorption_insulator	bem_simulator	Interface
sample_flux_weighted_normal_component	bem_injection_flux	Subroutine	flux-weighted half-range 正規分布から法線速度をサンプルする。
sample_photo_raycast_particles	bem_photoelectron_injection	Subroutine	光線を注入面からレイキャストし、最初の命中要素から光電子を放出する。
sample_photo_species_state	bem_app_config_particle_runtime	Interface
sample_reservoir_face_particles	bem_injection_flux	Subroutine	上流リザーバ境界から流入する粒子群を面注入としてサンプルする。
sample_reservoir_velocity_grid_particles	bem_injection_velocity_grid	Subroutine	速度グリッド分布から reservoir_face 粒子をサンプルする。 `velocity_grid_pdf_kind="phase_space"` では `max(v_n,0) f(v)` で流入粒子を選び、 `"flux_weighted"` では入力 `f` を流入粒子分布として扱う。
sample_shifted_maxwell_velocities	bem_injection_random	Subroutine	ドリフト速度付きMaxwell分布(温度または熱速度指定)から粒子速度を生成する。
sample_species_state	bem_app_config_particle_runtime	Interface
sample_standard_normal	bem_injection_random	Subroutine	Box–Muller法で標準正規乱数を生成し、任意形状配列へ詰める。
sample_uniform_positions	bem_injection_random	Subroutine	直方体領域 `[low, high]` 内で一様分布の初期位置をサンプリングする。
scan_obj	bem_importers	Subroutine	OBJを行走査して頂点数と三角形分割後の面数を事前計数する。
seed_particles_from_config	bem_app_config_particle_runtime	Subroutine	バッチ生成前に乱数シードだけを初期化する。
seed_rng	bem_injection_random	Subroutine	与えたシード列またはシステム時刻からFortran乱数生成器を初期化する。
segment_aabb_intersection_t	bem_collision	Subroutine	線分 `p(t)=p0+t*d` (`0<=t<=1`) とAABBの交差区間 `[t_entry,t_exit]` を返す。
segment_bbox_overlap	bem_collision	Function	線分のAABBと要素AABBの重なりを先に判定し、詳細交差計算を枝刈りする。
segment_bbox_overlap_precomputed	bem_collision	Function	事前計算済みの線分AABBと要素AABBの重なりを判定する。
segment_triangle_intersect	bem_collision	Subroutine	Möller–Trumbore法で線分と三角形の交差有無・線分パラメータ `t`・交点座標を計算する。
solve_matching_implicit_zero_mode	bem_matching_plane_implicit	Subroutine
solve_nonlinear_system	bem_sheath_model_core	Subroutine
solve_regularized_qr	bem_regularized_qr	Subroutine
solve_small_linear_system	bem_sheath_model_core	Subroutine
solve_zhao_branch_a	bem_sheath_model_core	Subroutine
solve_zhao_branch_b	bem_sheath_model_core	Subroutine
solve_zhao_branch_c	bem_sheath_model_core	Subroutine
solve_zhao_unknowns	bem_sheath_model_core	Subroutine
species_from_defaults	bem_app_config_types	Function	`[[particles.species]]` の既定値を返す。現行仕様では、列挙された粒子種は既定で有効とみなす。
species_number_density_m3	bem_app_config_particle_runtime	Function	粒子種設定から実効密度[m^-3]を返す。
species_number_density_m3	bem_config_helpers	Function	粒子種設定から有効粒子数密度 [1/m^3] を計算する。
species_temperature_k	bem_app_config_particle_runtime	Function	粒子種設定から実効温度[K]を返す。
species_temperature_k	bem_config_helpers	Function	粒子種設定から有効温度 [K] を計算する。
sph	bem_templates	Subroutine	球座標 `(theta, phi)` を中心 `c`・半径 `r` の直交座標へ変換する。
stop_config_error	bem_config_toml	Subroutine	診断を明示出力し、Intel の動的 ERROR STOP 文字列の問題を避ける。
strip_cr	bem_importers	Subroutine	行末の CR 文字 (char 13) をスペースに置換し、CRLF 改行の OBJ に対応する。
surface_model_id_from_name	bem_app_config_mesh_runtime	Function	表面モデル名をメッシュ要素用の整数IDへ変換する。
swe_free_current_term	bem_sheath_model_core	Function
symmetric_vacuum_bottom_field	bem_periodic_zero_mode_plan	Function
transition_corner_count	bem_templates	Function	長方形外周を反時計回りに見たとき、辺遷移で通過するコーナー数を返す。
transition_corners	bem_templates	Subroutine	辺遷移時に通過するコーナー列（最大3点）を返す。
try_newton_solve	bem_sheath_model_core	Subroutine
try_solve_zhao_branch_a	bem_sheath_model_core	Subroutine
try_solve_zhao_branch_b	bem_sheath_model_core	Subroutine
try_solve_zhao_branch_c	bem_sheath_model_core	Subroutine
try_solve_zhao_monotonic_scalar	bem_sheath_model_core	Subroutine	Type-B/C の定常電流式から ambient density を消去し、電位だけをbracketする。
try_solve_zhao_unknowns	bem_sheath_model_core	Subroutine	Zhao の零電流定常根を fail-closed な status 付きで探索する。
type_a_e2_sum_at_infinity	bem_sheath_model_core	Function
update_mesh_geometry	bem_mesh	Subroutine	頂点配列から重心・法線・AABB・代表長・collision grid を再構築する。
update_state	bem_coulomb_fmm_core	Interface
use_periodic2_cached_kneq0	bem_coulomb_fmm_periodic	Function
use_periodic2_root_operator	bem_coulomb_fmm_periodic	Function	periodic2 の root operator を使うか判定する。
validate_active_physics_config	bem_physics_config_types	Subroutine	有限画像、panel reference、cached k!=0 の periodic2 構成を検証する。
validate_boundary_inflow_species	bem_app_config_parser	Interface
validate_phase1_panel_config	bem_physics_config_types	Subroutine	triangle P0 direct/treecode/FMM kernel の solver/boundary 契約を検証する。
validate_photo_raycast_species	bem_app_config_parser	Interface
validate_plane_source_species	bem_app_config_parser	Interface
validate_reservoir_species	bem_app_config_parser	Interface
validate_restart_contract	bem_restart	Interface
warn_face_average_potential_variation	bem_app_config_potential_runtime	Subroutine	注入面の局所電位差が面平均 reservoir 近似の特徴エネルギーに対して大きい場合に警告する。
wrap_periodic2_point	bem_collision	Subroutine	point を primary cell へ折り返す。
wrap_periodic2_point	bem_coulomb_fmm_periodic	Subroutine	periodic2 領域内へ点座標を折り返す。
wrap_src_pos_to_primary_cell	bem_coulomb_fmm_periodic	Subroutine	plan 内の全ソース位置を primary cell `[target_box_min, target_box_min+L)` へ折り返す。
write_checkpoint_state_files	bem_output_writer	Subroutine	再開に必要な root-rank 共通状態だけをチェックポイントへ保存する。
write_macro_residuals_file	bem_restart	Interface
write_matching_plane_history_snapshot	bem_output_writer	Interface
write_periodic_operator_cache	bem_coulomb_fmm_periodic_cache	Subroutine
write_result_files	bem_output_writer	Subroutine	解析結果を `summary.txt` / `charges.csv` / `mesh_triangles.csv` などとして保存する。
write_rng_state_file	bem_restart	Interface
write_top_reference_history_snapshot	bem_output_writer	Interface
zhao_residuals_type_a	bem_sheath_model_core	Subroutine
zhao_residuals_type_b	bem_sheath_model_core	Subroutine
zhao_residuals_type_c	bem_sheath_model_core	Subroutine

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